MassARRAY System Comp UltraSEEK Colon Panel CPM
Agena Bioscience社の商品は2024年3月末日をもって取扱を終了いたしました。
- 研究用
MassARRAY® Systemは、エンドポイントPCRと、MALDI-TOFベースの質量分析技術を利用した、遺伝子解析プラットフォームです。 高度なマルチプレックス反応により、DNAの変異やメチル化を迅速に、高精度に、高い費用対効果で検出することが可能です。 材料が限られている場合の標的遺伝子検査に優れたソリューションを提供します。
本パネルは液体生検、新鮮組織やFFPE、細胞株をサンプルとし、大腸がん関連遺伝子（BRAF、KRAS、NRAS、EGFR、PIK3CA遺伝子）における107か所の変異を特定します。
必要なDNA量は1サンプルあたり10 ngです。対立遺伝子頻度わずか0.1%の変異を高感度に検出できるため、循環腫瘍細胞(CTC)や血中循環腫瘍DNA(ctDNA)を解析するリキッドバイオプシー研究にも利用できます。
※本製品はMassARRAY Analyzer 4 CPM専用です。Nanodispenser RS1000では使用できません。
2018/05/14 12:00の製品情報
本製品は研究目的にのみ使用し、人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないようにご注意ください。
製品の特長
本製品はUltraSEEK Chemistryを用い、大腸がんに関連する遺伝子の変異を高感度に検出できる解析パネルです。
＜UltraSEEK Chemistryについて＞
①PCRで変異箇所を含む領域を増幅後、②一塩基伸長反応を行います。③低頻度変異由来の増幅産物のみ、ストレプトアビジンで標識した磁性ビーズで回収し、④MassARRAY Analyzer 4で解析します。
実際の実験ステップについては英語マニュアルを参照してください。
＜解析する変異について＞
| 遺伝子名 | 解析箇所 | 解析変異数 |
| BRAF | Codons 469 (exon 11), 594, 600 (exon 15) | 5 |
| EGFR | Extracellular domain mutations in exon 12 | 10 |
| KRAS | Codons 12, 13 (exon 2), 59, 61 (exo 3), 117 and 146 (exon 4) | 48 |
| NRAS | Codons 12, 13 (exon 2), 59, 61 (exon 3), 117 and 146 (exon 4) | 40 |
| PIK3CA | Codons 542, 545 (exon 9) and 1047 (exon 20) | 4 |
| 合計 | 107 |
変異の詳細はこちらを参照してください。
解析する変異は、大腸がんに関連する5遺伝子中の107か所です。マルチプレックスPCRを行った後、1サンプル当たり12ウェルを利用して、各変異箇所の塩基の種類をMassARRAY Analyzer 4で分析します。
※肺がんに関連する遺伝子変異の解析にはUltraSEEK Lung Panel（製品コード：AGN-13136F/13138F）もしくはUltraSEEK EGFR Panel V2（13263F）、メラノーマに関連する遺伝子変異の解析はUltraSEEK Melanoma Panel（AGN-13152F/13154F）をご利用ください。
＜サンプルについて＞
以下のサンプル由来のDNAが解析可能です。
- 循環セルフリーDNA（ccfDNA）
- 新鮮な組織
- FFPE保存組織
- 細胞株
- 血漿
必要なDNA量は1サンプルあたり10 ngです。
＜本製品の構成について＞
本製品には以下の試薬が含まれます。
- パネル用のPCRプライマーおよび試薬
- UNG Enzyme（AGN-13143F/AGN-13145Fのみ）
→前回の実験に由来するPCR産物のコンタミネーションを防ぐために用います（使用推奨）。
- SAP試薬
- 一塩基伸長用プライマーおよび試薬
- ビーズキャプチャー用試薬
- 5種のcapture controlおよび1種のprocess control
→実験ステップのコントロールや半定量のため用います。
- その他解析試薬
- SpectroCHIP（96ウェルフォーマット）
※Clean Resinは含まれておりません。別途ご購入ください。(製品コード：AGN-8040)
※本製品を384ウェルフォーマットで解析する場合、MassARRAY Analyzer 4による解析までの実験は、96ウェルフォーマットで実施してください。
Agena社製以外の消耗品や機器の推奨品に関してはこちらを参照してください。
＜ソフトウェアでの結果表示例＞
＜レポート出力例＞
結果はレポート形式（HTMLまたはCSV/TXT）で出力可能です。
