注目の製品情報
2020/08/31
リキッドバイオプシーに最適!Streck社cfRNA/エクソソーム保存チューブ「RNA Complete BCT™」
- 細胞安定化 試料保存チューブ
リキッドバイオプシーは、血液などの液性検体中に含まれる遊離(セルフリー)生体分子を対象とする研究です。低侵襲・低コストな手法のため、がんを始めとする様々な疾病の早期発見や、疾病のモニタリングに利用するための研究が行われています。
Streck社が製造する血液保存チューブは細胞安定化技術を元に開発され、血液中の各種セルフリー物質を安定して保存することが可能です。
本ページでは、セルフリーRNA(cfRNA)とエクソソームを含む細胞外小胞(EV)を室温保存できる新製品 RNA Complete BCTをご紹介いたします。
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RNA Complete BCTの特長
Streck社 血液保存チューブ RNA Complete BCTは、血液中のCell-Free RNA(cfRNA)およびエクソソームを含むEVを長期間保存することが可能です。
室温でcfRNA、EVを7日間保存可能
血液細胞の破壊や溶血を防ぎ、血漿中のセルフリー成分を安定して保存することができます。
従来品はcfRNAのみ保存可能でしたが、本製品はエクソソームを含むEVも保存可能です。
細胞を安定化:EV量の変化を抑制
細胞が安定化するため、EVの濃度変化が抑制され、回収時の状態を保つことができます。
保存中のcfRNA分解を抑制
cfRNAの分解を抑制し、保存後のサンプルからも高品質のRNAを回収することができます。
NGS、ddPCRに利用可能
抽出後のcfRNAおよびEVは、NGS解析やddPCRに利用できます。
回収は通常の遠心機で実施でき、労力とコストを抑えることができます。
推奨抽出キット
cfRNA | QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit (Qiagen)
MagMAX Cell-Free Total Nucleic Acid Isolation Kit (ThermoFisher) Plasma/Serum Circulating and Exosomal RNA Purification Kit (Slurry Format, Norgen) |
EV | exoEasy (Qiagen)
exo-Spin (Cell Guidance Systems) Total Exosome Isolation Kit (ThermoFisher) |
血液中のcfRNA、エクソソームについて
リキッドバイオプシー(Liquid biopsy)*において、サンプルとして最も利用されているのは血液です。
血液中には、遊離(セルフリー)物質として、細胞から放出された物質や、アポトーシスなどで分解した細胞に由来する物質など、様々な生体分子が含まれています。
*血液や尿などの液体生検に含まれる生体分子を解析し、疾病との関連を研究する分野
血液中のセルフリー生体分子
cell-free DNA (cfDNA)
腫瘍由来のDNA(ctDNA)などが含まれます。
循環腫瘍細胞 (CTC)
組織から遊離した腫瘍細胞です。
cell-free RNA (cfRNA)
細胞外に放出されたRNAです。mRNAのほか、miRNA、lncRNA、snRNAなどのノンコーディングRNA(ncRNA)も含まれます。ncRNAはタンパクをコードしませんが、遺伝子発現、細胞機能に影響すると考えられています。
細胞外小胞(EV)
細胞が分泌する小胞の一つです。直径50-150 nmのものはエクソソームと言われています。
エクソソーム内部には核酸(mRNA、DNA)タンパク質などを含むほか、小胞膜にも脂質や膜タンパクが含まれています。細胞外に放出されたエクソソームは液中を循環し、別の細胞に取り込まれることから、細胞間のコミュニケーションを担う物質の一つと考えられています。
(Reclusa et al., Translational Lung Cancer Research, 2016)
リキッドバイオプシーでは疾患のバイオマーカーとして、とくにncRNAや異常細胞から分泌されるエクソソームに含まれる物質が注目されています。また、エクソソーム自体を治療法として利用する研究が行われています。
(Pardini et al., Cancers, 2019)
(Fitts et al., Advanced Healthcare Materials, 2019)
cfRNA、エクソソームの保存方法
血液サンプルを採取した後、溶血などが起きてしまうと、細胞中のRNAなどが遊離してしまいます。また、保存により分解が起こる可能性もあります。そうするとcfRNAやエクソソームの量・品質が回収時と異なってしまいます。
このため、採取後速やかに血漿を分離してcfRNAやエクソソームを抽出するか、細胞の破壊を抑えるためにEDTAなどの抗凝固剤を添加して保存する必要があります。
しかし、通常の抗凝固剤を利用した保存チューブは室温保存や長期保存により、細胞が徐々に破壊されてしまいます。
Streck社のRNA Compelete BCTは、通常の保存チューブと比べ、リキッドバイオプシーへの利用に適したcfRNA・エクソソームを含むEVの室温保存が可能です。
EDTAチューブとRNA Complete BCTの比較
通常の保存チューブ(EDTA含有チューブ)と、RNA Complete BCTの比較を行いました。
血液サンプルは採取後室温で7日間保存しました。
EDTA=EDTA含有チューブ
RNAC=RNA Complete BCT
①細胞の安定性
EDTAチューブでは保存により赤血球が破壊され、溶血現象が起こっていますが、RNA Complete BCTでは溶血が抑制されています。細胞が安定して保存されており、血漿サンプルが十分回収できることがわかります。
②cfRNAの安定性
BioAnalyzerで各チューブから抽出したcfRNAを分析しました。下部に行くほどRNAのサイズが短いことを示しています。
EDTAチューブでは7日間の保存により、RNAの切断や細胞破壊によりcfRNAの量やサイズ分布が変化していますが、RNA Complete BCTではほとんど変化がありません。
RNA-Seq解析の結果です。遺伝子発現量が保存前よりも高くなった、もしくは低くなった遺伝子がドットで示されています。EDTAチューブでは、保存前後で発現量の変化した遺伝子が多数検出されましたが、RNA Complete BCTは保存前とほぼ変わらない発現量を示しました。
RNA Complete BCTは、回収時のcfRNAの状態を保存することが可能です。
NGS解析の他、ddPCRによる定量にも利用できます。
③EVの安定性
粒子解析システムで観察したEVとその量の変化です。EDTAチューブでは保存によりEV量が変化していますが、RNA Complete BCTではほとんど変化がありません。細胞が安定化しているため、回収時のEV、エクソソームの状態が保存できます。
RNA Complete BCTを利用してサンプルを適切に保存することで、サンプル処理や実験をスムーズに進めることができます!
上記のデータは、Product Flyer(Streck社サイト:英語)に掲載されています。
NGS対応プロトコルもあります!
Streck社が作成した、RNA Complete BCTを利用したRNA-Seqプロトコルが公開されています。
サンプル調製から解析まで、使用する試薬や実験ステップが簡単に確認できます。
セルフリー・リキッドバイオプシー関連製品
Streck社 血液保存チューブラインナップ
詳細は各製品ページをご確認ください。
Streck採血管 Cell-Free DNA | cfDNA、CTCを保存 | 医療機器 |
RNA Complete BCT | cfRNA、エクソソームを保存 | 研究用機器 |
Streck採血管 Cyto-Chex | 白血球細胞を保存(フローサイトメトリー用) | 医療機器 |
尿中cfDNAの保存にはCell-Free DNA Urine Preserve
Cell-Free DNA Urine Preserveは、尿中cfDNAを常温で7日間まで安定保存できる保存液です。
細胞上清からのエクソソーム回収にはDynabeadsが便利です!
・表面に存在する膜タンパクを利用した免疫沈降
・特定のサブセットを高純度で回収
・フローサイトメトリーなどさまざまなダウンストリームに適用可能
詳しくは下記ページおよび製品ページをご確認ください。
【Dynabeads】Exosome(エキソソーム・エクソソーム)サブセットを検出・単離
MassARRAY UltraSEEK Panel
本品は、弊社での取扱いを終了しております(2024年3月)。
- リキッドバイオプシー対応遺伝子変異解析パネル
- 肺がん、大腸がんに関連する変異を検出
- LOD 0.1%
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Protein Plus BCT
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Nucleic Acid BCT (5 mL/10 mL)