HLA（ヒト白血球型抗原）技術情報用語集

連鎖不平衡

生物の集団において、複数の遺伝子座の対立遺伝子または遺伝的マーカー（多型）の間にランダムでない相関が見られる、すなわちそれらの特定の組合せ（ハプロタイプ）の頻度が有意に高くなる集団遺伝学的な現象を連鎖不平衡といいます。

下図は日本人集団におけるHLA-C遺伝子の連鎖不平衡の例です。
HLA-Cの抗原の日本人集団の頻度とHLA-B54を保有する人の連鎖を表しています。HLA-Cには多くの抗原型が存在するにもかかわらず、HLA-Cw1に著しく偏っています。
このようにHLA遺伝子群は連鎖不平衡をとっています。